Le fonds manuscrit constitue une composante du patrimoine national dans lequel se manifestent notre identité culturelle et les spécificités de notre civilisation. L'importance de ce fonds réside dans sa valeur historique, scientifique, artistique et esthétique.

Le fonds manuscrit de la BNRM est très riche (plus que 34.000 titres et 13.486 volumes)  et bien conservé et dont toutes les disciplines y sont traitées : de la théologie à la médecine, en passant par les mathématiques et les sciences humaines. Parfois plusieurs thèmes sans rapport les uns avec les autres sont traités dans un seul et même ouvrage . La fragilité des manuscrits ainsi que leur valeur, rendent la diffusion des originaux très limitée, voire interdite, à l'exception de l'exposition de quelques-uns lors des grandes manifestations culturelles. Leur communication se fait par un lecteur de microfilm, par un support numérique, par la reproduction sur papier, et surtout via le portail de la bibliothèque.